薬学科では６年一貫の体系的なカリキュラムと低学年時からの徹底した国家試験対策により、薬学共用試験と薬剤師国家試験の全員合格を全力でサポートしています。
2024年度の時点で長崎国際大学薬学部出身の薬剤師国家試験合格者数が1218名となりました。卒業生の93.1%が薬剤師免許を取得しています。長崎県438名をはじめ九州各地出身の薬剤師を輩出しています。

科学研究費補助金の採択に加え、日本生薬学会賞や日本油化学会賞の受賞者、日本緩和医療薬学会理事など薬学分野における最先端の研究実績を持つ多数の教員が、学生の知的好奇心・探究心を満たしてくれます。